CIBEX: Center for Information Biology gene EXpression database

Abstract

We describe the current status of the gene expression database CIBEX (Center for Information Biology gene EXpression database, http://cibex.nig.ac.jp), with a data retrieval system in compliance with MIAME, a standard that the MGED Society has developed for comparing and data produced in microarray experiments at different laboratories worldwide. CIBEX serves as a public repository for a wide range of high-throughput experimental data in gene expression research, including microarray-based experiments measuring mRNA, serial analysis of gene expression (SAGE tags), and mass spectrometry proteomic data. To cite this article: K. Ikeo et al., C. R. Biologies 326 (2003). Nous décrivons l'état actuel de la base de données d'expression génique CIBEX (Center for Information Biology gene EXpression database, http://cibex.nig.ac.jp), associée à un système d'interrogation compatible avec MIAME, standard développé par la société MGED dans le but de comparer les données issues d'expériences utilisant les microréseaux des laboratoires du monde entier. CIBEX sert de conservatoire public pour une large gamme de données expérimentales issues de la recherche à haut débit sur l'expression des gènes, incluant la mesure des ARNm à l'aide de microréseaux, l'analyse en série de l'expression génique (étiquettes SAGE) et des données protéomiques obtenues par spectrométrie de masse. Pour citer cet article : K. Ikeo et al., C. R. Biologies 326 (2003).